在进行网站结构设计时，遵循的最主要的原理是模块独立原理，也就是说，网站应该由一组完成相对独立的子功能的模块组成，这些模块彼此之间的接口关系应该尽量简单。在进行网站结构设计时是由抽象到具体地分析和构造出网站的层次结构，自顶而下逐步求精的进行网站结构设计。但是，如果已经有了详细的数据流图，也可以使用面向数据流的设计方法，用形式化的方法由数据流图影射出网站结构。
首先进行了网站的总体框架设计，确定了网站的功能和界面设计。模块分为：中医药新闻，网站介绍，中医药膏信息，推荐诊所，名医在线，在线答疑和膏方知识等。然后进行了数据库的设计，为了是网站尽量的人性化，数据库的设计考虑了许多的方面，以求尽可能的周全。完善网站的界面设计，使其生动且易操作。在代码的设计过程中，是一个不停改正错误不停进步的过程，最后经过系统测试，又对网站进行了完善。
医生会员模块：包括注册和登录
登录：用户在相应的用户名栏和密码栏填写自己的帐号和密码后，系统通过对数据库的校对后自动跳转至医师页面，提供用户进行各项操作；若校验失败则通过提示用户登录失败，提示用户重新登录或是注册会员。
医生会员注册模块：医可以进行在线注册，选择好诊所，填写姓名等详细资料后点击提交就可以进行注册了。
网站介绍：
对本网站的基本信息查行详细介绍。
膏药展示：
此模块膏药信息进行查看，可以按名称进行查询搜索。点击膏药图片可以查看膏药的详细内容。
推荐诊所：
可以按城市，信誉等级和诊所的名称进行查看和搜索。点击膏药图片可以查看该诊所的详细内容。如:名称，等级注册时间，地址等。
名医在线：
查看所有医生的信息。搜索医生名称，可以查看到此医生的姓名和所在诊所，简历等。
在线答疑：
游客可以进入此模块输入留言标题，姓名，内容提交进行提问。医生会员可以登录后回复游客提出的问题。
膏方知识：
显示所有膏方的信息。新闻咨询等。
